Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms