Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCSER1Q9C0I3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms