Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC4A5Q9BY07 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC4A5Q9BY07 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC4A5Q9BY07 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC4A5Q9BY07 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC4A5Q9BY07 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC4A5Q9BY07 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC4A5Q9BY07 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms