Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms