Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRIP1Q9BX63 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms