Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms