Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms