Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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