Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms