Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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