Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FYCO1Q9BQS8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms