Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms