Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms