Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP89Q96ST8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms