Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms