Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM3Q96MX0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms