Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
COG8Q96MW5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms