Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL4Q96JN8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms