Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ1Q96JM4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
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