Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms