Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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