Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms