Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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