Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC8Q96B26 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms