Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms