Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSH3Q8TE77 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSH3Q8TE77 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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