Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTRT1Q8TDG2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms