Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2BQ8NHM5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM2BQ8NHM5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms