Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CARMIL3Q8ND23 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms