Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf106Q8NAJ2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms