Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms