Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX3Q8N9I9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms