Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC33Q8N5R6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC33Q8N5R6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms