Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms