Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1Q7Z7E8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms