Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms