Protein–RNA interactions for Protein: Q71RH2

FAM57B, Protein FAM57B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM57BQ71RH2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM57BQ71RH2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM57BQ71RH2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms