Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms