Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC73Q6ZRK6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms