Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms