Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms