Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSSK4Q6SA08 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms