Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC9A4Q6AI14 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms