Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms