Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms