Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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