Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HES3Q5TGS1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms