Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRMS1LQ5PSV4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms