Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR44Q5JSH3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR44Q5JSH3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms