Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP13A4Q4VNC1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms